La estimulación magnética transcraneal repetitiva (rTMS) se ha explorado cada vez más para muchas afecciones neurológicas y neuropsiquiátricas. Sin embargo, la tasa de respuesta es variable dependiendo de las condiciones basales. La optimización de los protocolos de rTMS para mejorar los efectos del tratamiento y las tasas de respuesta dependerá de la evaluación confiable de las condiciones del estado cerebral. En este sentido, la optimización guiada de la actividad neuronal ha demostrado potencial en varios estudios de neuroimagen. En este artículo, presentamos nuestro trabajo continuo para optimizar el tratamiento de rTMS de un trastorno del equilibrio llamado Síndrome de Mal de Debarquement (MdDS), un trastorno de percepción del movimiento causado por el arrastre al movimiento de fondo. Nuestro trabajo anterior ha revelado que un marcador de neuroimagen de conectividad funcional en estado de reposo puede ayudar a predecir el efecto terapéutico. Motivado por nuestro estudio piloto anterior con fMRI, el presente estudio tiene como objetivo extender la investigación a los datos de EEG que fueron adquiridos simultáneamente con fMRI, con el objetivo de transferir el marcador de imágenes de fMRI a una tecnología de registro neural más accesible. Nuestros hallazgos actuales demuestran que la integración de EEG con medidas fMRI de sincronía neural y conectividad funcional puede ser prometedora en la optimización de protocolos rTMS.